纤维肌痛综合征一般是很少出现遗传的,本病的发病主要是与睡眠障碍、神经递质分泌异常以及免疫紊乱有一定的关系,睡眠障碍会累及60%到90%的病人,表现为睡眠不足、易醒、多梦、晨起精神不振、疲乏和有全身疼痛和沉僵感,多数患者由于精神紧张、环境噪音等都可加重睡眠障碍从而诱发本病的发生。
此外神经递质分泌异常也在本病的发病中起到重要作用,一些学者研究本病体内存在有急性血管损伤、组织缺氧及通透性增强,所以有免疫功能紊乱的情况。另外与一些感染也有一定的关系,尤其是腺病毒或螺旋体感染,但一般与遗传倾向并无直接的联系或者研究目前尚未发现。