韦格纳肉芽肿这个病是不能够根治,如果早期诊断,早期治疗,力争在内脏器官出现不可逆的损害之前给予积极的治疗,可以明显的改善这个病的预后。但是这个病总体的预后是不好的,没有经过治疗的韦格纳氏肉芽肿病人预后是非常差的,90%以上的患者都在两年内死亡。单纯通过糖皮质激素治疗的病人,平均生存期也仅仅有八个月,通常都死于呼吸衰竭或肾衰竭。
但是目前循证医学的证据表明,糖皮质激素和环磷酰胺的联合治疗能明显提高患者的疗效,诱导并维持疾病长期处于待缓解的状态,能达到这种状态在临床上也认为就是临床的缓解。别是对于这些伴有肾脏还有严重呼吸系统受累的患者,通过这样的治疗以后预后能有明显的改善,生活质量也能有所提高。