比较严重而典型的维生素b6缺乏是非常少见的,亚临床型的轻度缺乏更常见一些。当人体缺乏维生素b6的时,会伴有其他水溶性维生素缺乏。主要表现为皮肤和黏膜的炎症,比如脂溢性和脱屑性皮炎、口腔炎、舌炎与维生素b2烟酸缺乏症是类似的。其次是一些精神和神经系统的症状,比如抑郁、嗜睡、末梢神经炎、感觉和运动功能受损。
六个月以内的婴儿可以因频繁的癫痫样的抽搐,而引发智力发育迟缓。如果是维生素b6的缺乏发生在婴儿期,可以表现为生长速度减慢,神经兴奋性升高。由于抗体形成是减少的,比较容易引起继发感染,传染。有时候表现为小细胞性贫血,但血清铁蛋白水平升高,主要是由于铁的利用不充分引起的。伴有虚弱、易激惹、体重下降。维生素b6依赖综合征的患者,同样可以出现惊厥、贫血、支气管哮喘和胱氨酸尿症等等。