根除幽门杆菌感染临床上常见的药物有:枸橼酸铋钾,每日6~8毫克每千克,氨苄青霉素每日50毫克每千克,克拉霉素每日15~30毫克每千克,甲硝唑每日25~30毫克每千克,奥美拉唑每日0.6~0.8毫克每千克。
由于幽门螺旋杆菌栖居的部位、环境的特殊性不易根除,目前多主张二联或三联联合用药,以铋剂为中心药物的治疗方案为枸橼酸铋钾六周加氨苄青霉素四周或加甲硝唑2~4周或呋喃唑酮两周,亦有主张使用短程低剂量的二联或三联疗法者,即奥美拉唑加氨苄青霉素或克拉霉素两周,或奥美拉唑加克拉霉素加甲硝唑两周,根除率可达95%以上。