维生素b1缺乏与多种神经精神障碍有关,它所引起的严重的典型的精神神经病综合征是脚气病和脑病。其病理变化主要从乳头体、下丘脑、中脑导水管到第四脑室和小脑皮质等出现左右对称性血管周围内皮细胞肥厚,散发性出血等,并出现智力障碍,如涉及网状结构,则出现意识障碍。
当维生素b1缺乏,伴发糖代谢障碍时,可出现脑水肿,神经症状是由于维生素b1缺乏时,脑和脊髓充血、水肿、变性等所造成。上述改变以周围神经最为显著,四肢神经、膈神经、颅神经及迷走神经末端也较容易受累,常出现末梢神经炎、眼球震颤、眼球运动障碍、共济失调,偶有视网膜出血等。