一般来说在临床上微小的腔隙性脑梗塞由于一些小动脉壁发生脂质透明变性所导致的,而较大的腔隙性脑梗死为大一点的动脉粥样硬化或血栓形成所导致的,可以由脱落的或者是破碎的动脉粥样硬化斑块形成的微小栓子栓塞或由变性的动脉破裂出血所导致的。
或者是由于小灶出血,红细胞被破坏,小血肿被吸收,受损组织逐渐被清除,有胶质细胞,胶质纤维或胶原纤维所代替,从而形成瘢痕小出血灶可完全修复。稍大一点的出血灶常遗留囊腔,小灶的出血与梗死遗留的囊腔在显微镜下或肉眼观察脑标本时可见不同,但是在颅脑ct核磁共振检查成像时却难以区分。