绝大部分,直肠肛管周围脓肿是由肛腺感染所致,肛腺开口于肛窦,多位于内外括约肌之间,因肛窦开口向上,腹泻便秘时易发生,肛窦炎,感染,肛腺后首先易发生括约肌间的感染。
直肠肛管周围间隙为疏松的脂肪结缔组织,感染极易蔓延扩散,感染向上可达直肠周围形成高位肌间脓肿或者是骨盆直肠间隙脓肿,向下达肛管皮下形成肛门周围脓肿。向外穿过括约肌形成坐骨后肛管间隙脓肿。向后可形成肛管后间隙脓肿或者是直肠后间隙脓肿。以肛提肌为界,将直肠肛管脓肿分为肛提肌下部脓肿和肛提肌上部脓肿。
前者包括肛门周围脓肿,锁骨直肠间隙脓肿。后者包括骨盆,直肠间隙脓肿直肠后间隙脓肿和高位肌间脓肿,直肠肛管周围脓肿也可继发于肛周皮肤感染损伤,肛裂内置药物注射,骶尾骨骨髓炎等。