阴茎的表皮有坑可能是外伤、湿疹、包皮龟头炎、尖锐湿疣、生殖器疱疹等原因引起的，在用药物治疗时，建议遵医嘱使用。
1、外伤：
阴茎受到外伤，如摩擦、抓挠等，可能会导致皮肤破损，形成结痂，当结痂脱落时，表面可能会出现坑状，通常属于正常现象，不需要进行治疗。
2、湿疹：
由于该部位经常处于潮湿闷热的环境，可能会导致皮肤屏障机能下降，出现丘疹，当丘疹恢复后，表面会出现凹陷感，可以在医生的指导下外用使用炉甘石洗剂、丁酸氢化可的松乳膏、口服使用西替利嗪糖浆等药物进行治疗。
3、包皮龟头炎：
此疾病属于男性常见的生殖系统疾病，多由于包皮过长、包茎，以及细菌、真菌感染等因素引起。炎症反复刺激龟头和包皮表面，可能导致局部组织萎缩，进而出现坑坑洼洼的症状。可以，在医生的指导下使用红霉素软膏、金霉素软膏、醋酸曲安奈德乳膏等药物进行治疗。
4、尖锐湿疣：
尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染所致，主要通过性接触传播。感染后，病毒会在皮肤黏膜处生长繁殖，形成疣体。当疣体破裂时，可能出现溃疡，从而会出现不规则的坑洞。可以使用胸腺肽肠溶片、咪喹莫特乳膏、咪喹莫特乳膏进行治疗。
5、生殖器疱疹：
生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起的性传播疾病，主要表现为外生殖器或肛门周围出现水疱、糜烂或溃疡。这些症状过后可能呈现为不规则的凹陷，伴随疼痛和触痛感。可以使用阿昔洛韦片、头孢克肟胶囊、外用喷昔洛韦乳膏进行治疗。
在使用药物治疗时，避免吃一些辛辣、刺激性食物，如辣椒、大蒜、芥末等，同时建议每天保证8小时的充足睡眠，避免过度劳累和熬夜。
